脊膜瘤独特的甲基化和基因组学特征

脊髓脑膜瘤（SM）占原发性脑膜瘤的5-10%，占脊髓硬膜内肿瘤的30%。SMs通常是散发性的，很少与遗传性疾病如2型神经纤维瘤病或神经鞘瘤病相关^[1-3]。

SMs是生长缓慢的良性肿瘤，由于脊髓受压，在晚期可能会导致各种神经功能缺损。手术切除是症状性SM的首选治疗方法。一般来说，手术的目的是实现肿瘤的完全切除，并减轻神经症状。手术治疗的SM的功能结果通常良好，报道表明95%的脊膜瘤患者可以达到完全切除^[4,5]。

尽管颅内脑膜瘤的基因组学特征已被广泛研究^[6-9]，但我们对SM的分子特征的理解仍然不完整。先前的研究报告了WHO 1级脑膜瘤中AKT1、TRAF7、SMO、KLF4和PIK3CA的高频突变。然而，这些发现主要发生在颅内脑膜瘤，而SMs的表现不足^[6,7]。因此，到目前为止，没有足够的资料和研究对SMs的基因组特征和基因组与临床相关性做出结论。

来自复旦大学附属华山医院神经外科脑膜瘤团队和德国德斯顿大学的脑膜瘤团队在今年9月份发表在Acta Neuropathologica的文章“Two predominant molecular subtypes of spinal meningioma: thoracic NF2-mutant tumors strongly associated with female sex, and cervical AKT1-mutant tumors originating ventral to the spinal cord”首次阐明了脊膜瘤中的突变特征和特征与临床特征之间的相关性^[8]，作者纳入了50例WHO 1级的初发脊膜瘤患者，并对其进行了靶向测序，结果表明，AKT1E17K和NF2突变是脊膜瘤中最常见得突变，分别发生于30%和64%的患者，并且与颅内脑膜瘤相似，NF2突变与AKT1的突变相互排斥，进一步与临床特征的相关性分析表明，与AKT1突变的脊膜瘤患者相比，NF2突变的患者发病年龄更低（中位数为65岁），NF2突变多发生在女性患者中，且多发生在胸部脊髓，NF2突变的肿瘤中也更容易出现钙化，而AKT1突变的脊膜瘤没有一例出现钙化，作者的数据表明NF2和AKT1是WHO 1级脊膜瘤的驱动突变，因为约94%的病例中存在这些基因的突变。AKT1和NF2突变以相互排斥的模式出现，并且与独特的临床特征相关（图1）。

今年11月份来自德国汉堡大学医学中心发表在Acta Neuropathologica上的另一篇文章“Genetic and epigenetic profiling identifies two distinct classes of spinal meningiomas”另外对脊膜瘤的甲基化特征做了分析^[9]，作者对65例经组织学证实的脊髓脑膜瘤患者的肿瘤样本进行了遗传和表观遗传分析。全基因组DNA甲基化结果分析显示，大多数脊柱脑膜瘤与颅内脑膜瘤不同，脊膜瘤与脑膜瘤形成两个不同的簇（图2a，b）。聚类1中19例病例中有16例（84%）与甲基化类别“benign-2”明显匹配^[10]，而聚类2更为独特，只有5例样本达到显著匹配（图2c和d）。此外，所有经验证的AKT1 E17K突变病例均位于聚类1中，构成了该聚类的大部分。在聚类2的24例脊髓脑膜瘤（75%）中检测到了NF2突变，但聚类1中仅1例肿瘤出现了NF2突变。

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